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溶質キャリアファミリー

膜輸送タンパク質の溶質キャリア （ SLC ）グループには、65のファミリーに編成された400を超えるメンバーが含まれます。 SLCグループのほとんどのメンバーは細胞膜に位置しています。 SLC遺伝子命名体系は、当初HUGO遺伝子命名委員会（HGNC）によって提案され、これらのトランスポーターをコードする遺伝子の公式HGNC名の基礎となっています。より一般的な膜貫通輸送体の分類は、TCDBデータベースにあります。

さまざまなSLCグループメンバーによって輸送される溶質は非常に多様であり、帯電した有機分子と帯電していない有機分子の両方、および無機イオンとガスアンモニアが含まれます。

内在性膜タンパク質の典型であるように、SLCには、親水性細胞内および細胞外ループによって互いに接続された多数の疎水性膜貫通アルファヘリックスが含まれています。 SLCに応じて、これらのトランスポーターはモノマーとして機能するか、ホモまたはヘテロオリゴマーを強制します。多くのSLCファミリーは、主要なファシリテーターのスーパーファミリーのメンバーです。

範囲

命名法の慣例により、個々のSLCファミリー内のメンバーは互いに20〜25％を超える配列相同性を持っています。対照的に、SLCファミリー間の相同性は非常に低いか、存在しません。したがって、SLCグループにファミリーを含めるための基準は、他のSLCファミリーとの進化的関連性ではなく、むしろ機能的（すなわち、溶質を輸送する内在性膜タンパク質）です。

SLCグループには、以下の輸送タンパク質の例が含まれています。

  • 促進輸送体（電気化学的勾配で溶質を下り坂に流すことができます）
  • 二次アクティブトランスポーター（全体の自由エネルギーの変化が依然として好ましいように勾配で下り坂を流れる第2溶質の輸送に結合することにより、電気化学勾配に対して溶質が上り坂で流れることを許可します）

SLCシリーズには、以下を含む他の広く受け入れられている命名法システムによって以前に分類された輸送タンパク質ファミリーのメンバーは含まれません。

  • ATP加水分解などのエネルギー放出イベントに輸送を結合することによるABC（ATPバインディングカセット）輸送機などのプライマリアクティブ輸送機（電気化学的勾配に対する上り坂の流れを許可）
  • イオンチャンネル
  • アクアポリン（水チャネル）

細胞内分布

SLCグループのほとんどのメンバーは細胞膜にありますが、一部のメンバーはミトコンドリア（最も顕著なものはSLCファミリー25）または他の細胞内オルガネラにあります。

命名システム

個々のSLCメンバーの名前の形式は次のとおりです。

  • SLCnXm

どこ：

  • SLCはルート名です（ S o L ute C arrier）
  • n =ファミリを表す整数（1〜52など）
  • X =サブファミリーを示す単一の文字（A、B、C、...）
  • m =個々の家族メンバー（アイソフォーム）を表す整数。

たとえば、 SLC1A1はSLCファミリー1のサブファミリーAの最初のアイソフォームです。

SLCファミリー21（有機アニオン輸送ポリペプチド輸送体）で例外が発生します。これは、歴史的な理由により、SLCOnXmという形式の名前を持ちます（n =ファミリー番号、X =サブファミリー文字、m =メンバー番号）。

HGNCは命名法を人間の遺伝子にのみ割り当てますが、慣例により、これらの遺伝子の脊椎動物のオルソログは同じ命名法を採用します（たとえば、SLC10A1のVGNCが割り当てたオルソログ）。げっ歯類の場合、記号の大文字と小文字は他の脊椎動物とはタイトルの大文字と小文字が異なります。つまり、Slc1a1はヒトSLC1A1遺伝子のげっ歯類オーソログを示します。

家族

  • （1）高親和性グルタミン酸および中性アミノ酸輸送体
    • （SLC1A1、SLC1A2、SLC1A3、SLC1A4、SLC1A5、SLC1A6、SLC1A7）
  • （2）促進GLUTトランスポーター
    • （SLC2A1、SLC2A2、SLC2A3、SLC2A4、SLC2A5、SLC2A6、SLC2A7、SLC2A8、SLC2A9、SLC2A10、SLC2A11、SLC2A12、SLC2A13、SLC2A14）
  • （3）ヘテロ二量体アミノ酸輸送体の重サブユニット
    • （SLC3A1、SLC3A2）
  • （4）重炭酸トランスポーター
    • （SLC4A1、SLC4A2、SLC4A3、SLC4A4、SLC4A5、SLC4A6、SLC4A7、SLC4A8、SLC4A9、SLC4A10、SLC4A11）
  • （5）ナトリウムグルコース共輸送体
    • （SLC5A1、SLC5A2、SLC5A3、SLC5A4、SLC5A5、SLC5A6、SLC5A7、SLC5A8、SLC5A9、SLC5A10、SLC5A11、SLC5A12）
  • （6）ナトリウムおよび塩化物依存性ナトリウム：神経伝達物質の共輸送体
    • （SLC6A1、SLC6A2、SLC6A3、SLC6A4、SLC6A5、SLC6A6、SLC6A7、SLC6A8、SLC6A9、SLC6A10、SLC6A11、SLC6A12、SLC6A13、SLC6A14、LC6A19、SLC6A16、SLC6A16、SLC6A16、SLC6A16、SLC6A16、SLC6A16、SLC6A16、LC
  • （7）カチオン性アミノ酸輸送体/糖タンパク質関連
    • カチオン性アミノ酸トランスポーター（SLC7A1、SLC7A2、SLC7A3、SLC7A4）
    • ヘテロ二量体アミノ酸輸送体の糖タンパク質関連/軽または触媒サブユニット（SLC7A5、SLC7A6、SLC7A7、SLC7A8、SLC7A9、SLC7A10、SLC7A11、SLC7A13、SLC7A14）
  • （8）Na + / Ca2 +交換体
    • （SLC8A1、SLC8A2、SLC8A3）
  • （9）Na + / H +交換体
    • （SLC9A1、SLC9A2、SLC9A3、SLC9A4、SLC9A5、SLC9A6、SLC9A7、SLC9A8、SLC9A9、SLC9A10、SLC9A11、SLC9B1、SLC9B2）
  • （10）胆汁酸ナトリウム共輸送
    • （SLC10A1、SLC10A2、SLC10A3、SLC10A4、SLC10A5、SLC10A6、SLC10A7）
  • （11）プロトン結合金属イオン輸送体
    • （SLC11A1、SLC11A2）
  • （12）電気中性カチオン-Cl共輸送体
    • （SLC12A1、SLC12A1、SLC12A2、SLC12A3、SLC12A4、SLC12A5、SLC12A6、SLC12A7、SLC12A8、SLC12A9）
  • （13）Na +-硫酸塩/カルボン酸塩共輸送体
    • （SLC13A1、SLC13A2、SLC13A3、SLC13A4、SLC13A5）
  • （14）尿素トランスポーター
    • （SLC14A1、SLC14A2）
  • （15）プロトンオリゴペプチド共輸送体
    • （SLC15A1、SLC15A2、SLC15A3、SLC15A4）
  • （16）モノカルボン酸輸送体
    • （SLC16A1、SLC16A2、SLC16A3、SLC16A4、SLC16A5、SLC16A6、SLC16A7、SLC16A8、SLC16A9、SLC16A10、SLC16A11、SLC16A12、SLC16A13、SLC16A14）
  • （17）小胞性グルタミン酸輸送体
    • （SLC17A1、SLC17A2、SLC17A3、SLC17A4、SLC17A5、SLC17A6、SLC17A7、SLC17A8、SLC17A9）
  • （18）小胞性アミン輸送体
    • （SLC18A1、SLC18A2、SLC18A3）
  • （19）葉酸/チアミン輸送体
    • （SLC19A1、SLC19A2、SLC19A3）
  • （20）III型Na +-リン酸共輸送体
    • （SLC20A1、SLC20A2）
  • （21）有機アニオン輸送
    • サブファミリー1（SLCO1A2、SLCO1B1、SLCO1B3、SLCO1C1）
    • サブファミリー2（SLCO2A1、SLCO2B1）
    • サブファミリー3（SLCO3A1）
    • サブファミリー4（SLCO4A1、SLCO4C1）
    • サブファミリー5（SLCO5A1）
    • サブファミリー6（SLCO6A1）
  • （22）有機陽イオン/陰イオン/双性イオン輸送体
    • （SLC22A1、SLC22A2、SLC22A3、SLC22A4、SLC22A5、SLC22A6、SLC22A7、SLC22A8、SLC22A9、SLC22A10、SLC22A11、SLC22A12、SLC22A13、SLC22A14、SLC22A15、SLC22A16、SLC22A17、SLC22A18、SLC22A18AS、SLC22A19、SLC22A20、SLC22A23、SLC22A24、SLC22A25、SLC22A31 ）
  • （23）Na +依存性アスコルビン酸輸送体
    • （SLC23A1、SLC23A2、SLC23A3、SLC23A4）
  • （24）Na + /（Ca2 + -K +）エクスチェンジャー
    • （SLC24A1、SLC24A2、SLC24A3、SLC24A4、SLC24A5、SLC24A6）
  • （25）ミトコンドリアキャリア
    • （SLC25A1、SLC25A2、SLC25A3、SLC25A4、SLC25A5、SLC25A6、SLC25A7、SLC25A8、SLC25A9、SLC25A10、SLC25A11、SLC25A12、SLC25A13、SLC25A25、SLC25A25、SLC25A25、SLC25A25、SLC25A25、SLC25A25、ALC 、SLC25A26、SLC25A27、SLC25A28、SLC25A29、SLC25A30、SLC25A31、SLC25A32、SLC25A33、SLC25A34、SLC25A35、SLC25A36、SLC25A37、SLC25A38、SLC25ALC、LCA25ALC、LCA25ALC、LCA25ALC
  • （26）多機能アニオン交換体
    • （SLC26A1、SLC26A2、SLC26A3、SLC26A4、SLC26A5、SLC26A6、SLC26A7、SLC26A8、SLC26A9、SLC26A10、SLC26A11）
  • （27）脂肪酸輸送タンパク質
    • （SLC27A1、SLC27A2、SLC27A3、SLC27A4、SLC27A5、SLC27A6）
  • （28）Na +結合ヌクレオシド輸送
    • （SLC28A1、SLC28A2、SLC28A3）
  • （29）促進性ヌクレオシド輸送体
    • （SLC29A1、SLC29A2、SLC29A3、SLC29A4）
  • （30）亜鉛トランスポーター
    • （SLC30A1、SLC30A2、SLC30A3、SLC30A4、SLC30A5、SLC30A6、SLC30A7、SLC30A8、SLC30A9、SLC30A10）
  • （31）銅トランスポーター
    • （SLC31A1、SLC31A2）
  • （32）小胞抑制性アミノ酸輸送体
    • （SLC32A1）
  • （33）アセチルCoAトランスポーター
    • （SLC33A1）
  • （34）タイプII Na +-リン酸共輸送体
    • （SLC34A1、SLC34A2、SLC34A3）
  • （35）ヌクレオチド糖輸送体
    • サブファミリーA（SLC35A1、SLC35A2、SLC35A3、SLC35A4、SLC35A5）
    • サブファミリーB（SLC35B1、SLC35B2、SLC35B3、SLC35B4）
    • サブファミリーC（SLC35C1、SLC35C2）
    • サブファミリーD（SLC35D1、SLC35D2、SLC35D3）
    • サブファミリーE（SLC35E1、SLC35E2、SLC35E3、SLC35E4）
    • サブファミリーF（SLC35F1、SLC35F2、SLC35F3、SLC35F4、SLC35F5）
    • サブファミリーG（SLC35G1、SLC35G3、SLC35G4、SLC35G5、SLC35G6）
  • （36）プロトン共役アミノ酸輸送体
    • （SLC36A1、SLC36A2、SLC36A3、SLC36A4）
  • （37）糖リン酸/リン酸交換体
    • （SLC37A1、SLC37A2、SLC37A3、SLC37A4）
  • （38）システムAおよびN、ナトリウム結合中性アミノ酸輸送体
    • （SLC38A1、SLC38A2、SLC38A3、SLC38A4、SLC38A5、SLC38A6、SLC38A7、SLC38A8、SLC38A9、SLC38A10、SLC38A11）
  • （39）金属イオン輸送体
    • （SLC39A1、SLC39A2、SLC39A3、SLC39A4、SLC39A5、SLC39A6、SLC39A7、SLC39A8、SLC39A9、SLC39A10、SLC39A11、SLC39A12、SLC39A13、SLC39A14）
  • （40）基底外側鉄輸送体
    • （SLC40A1）
  • （41）MgtE様マグネシウム輸送体
    • （SLC41A1、SLC41A2、SLC41A3）
  • （42）アンモニアトランスポーター
    • （RhAG、RhBG、RhCG）
  • （43）Na +非依存、システムLのようなアミノ酸輸送体
    • （SLC43A1、SLC43A2、SLC43A3）
  • （44）コリン様輸送体
    • （SLC44A1、SLC44A2、SLC44A3、SLC44A4、SLC44A5）
  • （45）推定糖輸送体
    • （SLC45A1、SLC45A2、SLC45A3、SLC45A4）
  • （46）葉酸トランスポーター
    • （SLC46A1、SLC46A2、SLC46A3）
  • （47）多剤および毒素排出
    • （SLC47A1、SLC47A2）
  • （48）ヘムトランスポーターファミリー
    • （SLC48A1）
  • （49）Heme_transporter
    • （SLC49A1、SLC49A2、SLC49A3、SLC49A4）
  • （50）SWEETファミリーの糖流出トランスポーター
    • （SLC50A1）
  • （51）ステロイド由来分子の輸送体
    • （SLC51A、SLC51B）
  • （52）リボフラビントランスポーターファミリーRFVT / SLC52
    • （SLC52A1、SLC52A2、SLC52A3）
  • （53）リン酸キャリア
    • （SLC53A1）
  • （54）ミトコンドリアのピルビン酸キャリア
    • （SLC54A1、SLC54A2、SLC54A3）
  • （55）ミトコンドリア陽イオン/プロトン交換体
    • （SLC55A1、SLC55A2、SLC55A3）
  • （56）シデロフレキシン
    • （SLC56A1、SLC56A2、SLC56A3、SLC56A4、SLC56A5）
  • （57）NiPA様マグネシウム輸送体ファミリー
    • （SLC57A1、SLC57A2、SLC57A3、SLC57A4、SLC57A5、SLC57A6）
  • （58）MagTのようなマグネシウム輸送体ファミリー
    • （SLC58A1、SLC58A2）
  • （59）ナトリウム依存性リゾホスファチジルコリン共輸送体ファミリー
    • （SLC59A1、SLC59A2）
  • （60）グルコース輸送体
    • （SLC60A1、SLC60A2）
  • （61）モリブデン酸輸送体ファミリー
    • （SLC61A1）
  • （62）ピロリン酸輸送体
    • （SLC62A1）
  • （63）スフィンゴシンリン酸輸送体
    • （SLC63A1、SLC63A2、SLC63A3）
  • （64）ゴルジCa2 + / H +交換体
    • （SLC64A1）
  • （65）NPC型コレステロール輸送体
    • （SLC65A1、SLC65A2）

推定SLC

非定型SLCとも呼ばれる推定SLCは、既知のSLCと祖先の背景を共有する、新規でもっともらしい二次活性または促進性トランスポータータンパク質です。ただし、SLCルートシステムに従って名前が割り当てられていないか、既存のSLCファミリのいずれかに分類されていません。ただし、MFSタイプの非定型SLCは、15の推定MFSトランスポーターファミリー（AMTF）に細分化できます。

すべての推定SLCはもっともらしいSLCトランスポーターです。名前に関しては、「非定型」です。遺伝子はSLCルートシステムに従って呼び出されません。

以下に、いくつかの推定SLCを示します。OCA2、CLN3、TMEM104、SPNS1、SPNS2、SPNS3、SV2A、SV2B、SV2C、SVOP、SVOPL、MFSD1、MFSD2A、MFSD2B、MFSD3、MFSD4A、MFSD4B、MFSD5、MFSD6、MFSD6L、MFSD、MFSD6、MFSD6L、MFSD6 、MFSD10、MFSD11、MFSD12、MFSD13A、MFSD14A、MFSD14B、UNC93A、UNC93B1。

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