ポリントン

ポリントン （ Mavericksとも呼ばれる）は、ウイルスタンパク質と相同性のある遺伝子を含む大きなDNAトランスポゾンであり、真核生物のゲノムによく見られます。それらは2000年代半ばに最初に発見され、最大かつ最も複雑な既知のDNAトランスポゾンです。 Polintonsは10の個々のタンパク質までエンコードし、二つの重要なタンパク質、DNA ルポール ymeraseおよびレトロウイルスのようなint型 egraseから自分の名前を導き出します。

物性

典型的なポリントンのサイズは約15〜20キロベースペアですが、例は40 kbまで記述されています。ポリトンは最大10個のタンパク質をエンコードします。主要な要素は、タンパク質プライムB型DNAポリメラーゼと、その名前の由来となるレトロウイルス様インテグラーゼです。ポリトンは、自己複製に必要なタンパク質をコードするため、「自己合成」トランスポゾンと呼ばれることもあります。ほとんどのポリントンは、アデノウイルス様システインプロテアーゼ、FtsK様ATPアーゼ、およびウイルスキャプシドタンパク質のゼリーロールフォールド構造と相同性のあるタンパク質もコードします。推定キャプシドタンパク質の存在は、ポリントンが特定の条件下でビリオンを形成できる可能性があることを示唆しています。ただし、これは実験的に実証されていません。

Polintonシーケンスには、通常は100〜1000塩基対程度の転位因子に特徴的な末端逆方向反復が含まれます。また、挿入部位に6bpの標的部位複製配列を持っています。

分布

花粉は、古細菌（紅藻、緑藻、緑藻植物、陸上植物を含む）以外のすべての真核生物のグループで検出されています。動物を含むグループであるユニコンでは特によく見られます。トリコモナス症を引き起こす病原性膣トリコモナスは、最大30％のポリントンで構成されるユニークなゲノムを持っています。

進化

ポリントンの初期の記述は、少なくとも10億年前の古代のものである可能性が高く、おそらく現代の真核生物の初期の祖先と関連していると特定しました。ポリントンの水平遺伝子導入が報告されています）。

ポリントン、二本鎖DNAウイルス、利己的な遺伝的要素の間の進化的関係は複雑です。ポリントンの最初の記述は、線形プラスミド、バクテリオファージ、およびアデノウイルスとの配列関係によってそれらを結び付けました。最近では、ポリントン、ウィルス、および巨大ウイルスの間の関係が確認されています。ポリトンは、真核生物ゲノムの利己的な遺伝要素と二本鎖DNAウイルスをリンクする複雑な遺伝ネットワークの1つのコンポーネントを形成すると考えられています。少なくとも1つ、通常はいくつかの遺伝子の相同性により、ポリントンは進化的に線形プラスミド、ウイルスファージ （特にMavirusウイルスファージ 、 ラビダウイルス科）、ジャイアントウイルス（ メガウイルス）、ジンジャー1トランスポゾン、Tlr1トランスポゾン、トランスポビロン、 アデノウイルス科の真核ウイルスに進化的にリンクされます、およびTectiviridaeファミリーのバクテリオファージ。

発見と命名法

巨大転移因子は、2000年代半ばに最初に発見され、レトロウイルス様インテグラーゼタンパク質の新規ファミリーの記述から始まり、 Mavericksという名前の転移因子に関連付けられました。一方、転移因子の重複クラスは、ブラディミール・カピトノブとジェジー・ジューカにより、重要なタンパク質のPOLの ymeraseとint型 egrase由来、名前polintonsで説明しました。両方の用語は一般的に使用され続けています。

ウイルスのカプシド様タンパク質と自己複製能力のため、ポリントンはビリオンを形成する能力があり、適切にポリントウイルスと呼ばれることが示唆されています。しかし、この用語はまだ受け入れられておらず、ビリオン仮説の実験的検証を待っています。