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生物学
本質的な終了
Rho非依存性終結は、RNA転写を停止させ、新しく作られたRNAを放出させる原核生物のメカニズムです。このメカニズムでは、mRNAはそれ自体と塩基対を形成して、シトシン-グアニン塩基対も豊富な長さ7〜20塩基対のステムループ構造を形成できる配列を含んでいます。 CG塩基対は、重要な塩基スタッキング相互作用（特に繰り返されるGCペア）を持ち、互いに3つの水素結合を形成し、安定したRNA二重鎖をもたらします。ステムループ構造に続くのは、ウラシル残基の鎖です。ウラシルとアデニンの結合は非常に弱いです。 RNAポリメラーゼに結合したタンパク質（ nusA ）は、ポリメラーゼを一時的に停止させるのに十分なほどしっかりとステムループ構造に結合します。ポリメラーゼのこの一時停止は、ポリウラシル配列の転写と一致します。弱いアデニン-ウラシル結合は、RNA-DNA二重鎖の不安定化エネルギーを低下させ、RNAポリメラーゼからほどけて解離します。
ポリウラシル配列が続かないステムループ構造により、RNAポリメラーゼが一時停止しますが、二重鎖が安定しすぎて十分にほどけて終了しないため、通常は短時間後に転写を継続します。
Rho非依存性転写終結は、リボスイッチなどのシス作用性RNA調節エレメントの活性の基礎となる頻繁なメカニズムです。
参照資料
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