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エボラウイルス

エボラウイルス属(/ iːˌboʊləˈvaɪrəs / ee-BOH-lə-VY-rəs )は、 フィロウイルス科モノネガウイルス目に含まれるウイルス学的分類群です。この属のメンバーはエボラウイルスと呼ばれます。 6つの既知のウイルス種は、それぞれが最初に同定された地域にちなんで命名されています: ブンディブギョエボラ ウイルスレストンエボラウイルススーダンエボラウイルスタイフォレストエボラウイルス (元々はコートジボワールエボラウイルス )、 ザイールエボラウイルス 、およびボンバリエボラウイルス 。後者は、命名される最も最近の種であり、シエラレオネのアンゴラの自由尾のコウモリから分離されました。

エボラウイルス属の各種には1つのメンバーウイルスがあり、そのうち4つはヒトでエボラウイルス病(EVD)を引き起こします。これは、致死率が非常に高い出血熱の一種です。レストンウイルスは、他の霊長類でEVDを引き起こしました。 ザイールエボラウイルスはエボラウイルスの型種(参照または例えば種)であるebolavirusesの最も高い死亡率を有し、1976年ザイールの流行と流行を含む属の6既知の種の発生の最大数、の原因であります死亡者数が最も多い(2014年)。

エボラウイルスは、1976年6月に南スーダンで、そして1976年8月にザイールでEVDが発生した後に初めて記述されました。 エボラウイルスの名前は、1976年の発生場所であるザイール(現在のコンゴ民主共和国)のエボラ川に由来し、分類上の接尾辞-virus (ウイルス属を示す)。この属は1998年に「エボラ様ウイルス」として導入されました。 2002年に名前がEbolavirusに変更され、2010年に属が修正されました。エボラウイルスはマールブルグウイルスと密接に関連しています。

エボラウイルスのホスト

研究者は、3種のフルーツバットでエボラ感染の証拠を発見しました。コウモリは病気の症状を示さず、エボラウイルスの主要な自然の貯蔵庫である可能性があることを示しています。他のリザーバーとベクターがある可能性があります。アウトブレイクの間でウイルスがwhere化する場所と種間でどのように伝染するかを理解することは、人間や他の霊長類をウイルスから守るのに役立ちます。

研究者たちは、フランケットの肩章付きコウモリ( Epomops franqueti )、ハンマーヘッドコウモリ( Hypsignathus monstrosus )、および首輪の小さなコウモリ( Myonycteris torquata )の3種類のコウモリがRNAとして知られるエボラウイルス由来の遺伝物質を持っていることを発見しましたシーケンス、または疾患に対する免疫応答の証拠。コウモリ自身は症状を示しませんでした。

Bombali ebolavirus(BOMV)は、シエラレオネの小さな自由尾のコウモリ( Chaerephon pumilus )およびアンゴラの自由尾のコウモリ( Mops condylurus )から分離されました。

分類ノート

国際ウイルス分類委員会(ICTV)によって確立された分類群の命名規則に従って、 エボラウイルス属の名前は常に大文字で、イタリック体で、省略されず、「genus」という語が前に付けられます。そのメンバー(エボラウイルス)の名前は小文字で書かれ、イタリック体ではなく、記事なしで使用されます。

属の選択基準

フィロウイルス科のウイルスは、 エボラウイルス属のメンバーです。

  • そのゲノムにはいくつかの遺伝子重複がある
  • 4番目の遺伝子( GP )は、ssGPおよびGP1,2を発現するための共転写編集と、sGPおよびΔ-ペプチドを発現するためのタンパク質分解切断を使用して、4つのタンパク質(sGP、ssGP、Δ-ペプチド、およびGP1,2)をコードします
  • そのビリオンのピーク感染性は、長さ≈805nmの粒子に関連しています
  • そのゲノムはヌクレオチドレベルでマールブルクウイルスのゲノムと≥50%、エボラウイルスのゲノムと50%異なります
  • そのビリオンは、マールブルグビリオンと抗原性交差反応性をほとんど示さない

分類

エボラウイルス属とマールブルク ウイルス属は、現在では廃止されたフィロウイルス属の種として元々分類されていました 。 1998年3月、脊椎動物ウイルス小委員会は、国際ウイルス分類委員会(ICTV)で、 フィロウイルス属を、 エボラ様ウイルスマールブルグ 様ウイルスという 2つの特定の属を持つフィロウイルス科に変更することを提案しました。この提案は、2001年4月にワシントンDCで、2002年7月にパリで実施されました。2000年に、ワシントンDCで「-like virus」を「-virus」に変更し、今日のエボラウイルスおよびマールブルグウイルス

エボラウイルス属の特徴的な5つの種は次のとおりです。

ザイールエボラウイルス(ZEBOV)単にザイールウイルスとしても知られるZEBOVは、27年間で最高の致死率を示し、一部の流行では最大90%、平均致死率は約83%です。 ザイールエボラウイルスは、他の種よりも多く発生しています。最初の発生は、1976年8月26日にYambukuで発生しました。 44歳の学校教師であるMabalo Lokelaは、初めて記録された症例になりました。症状はマラリアに似ており、その後の患者にはキニーネが投与されました。感染は、滅菌されていない針の再利用と密接な個人的接触に起因しています。このウイルスは、2014年の西アフリカエボラウイルスの発生の原因であり、これまでで最も多くの死者を出しました。スーダンエボラウイルス(SUDV)ZEBOVと同様に、SUDVは1976年に出現しました。最初はZEBOVと同一であると想定されていました。 SUDVは、1976年6月にスーダンのNzara(現在は南スーダン)の綿工場労働者の間で最初に発生したと考えられており、最初の症例は潜在的な自然貯水池にさらされた労働者として報告されました。科学者はこれに応じて地元の動物や昆虫をテストしました。ただし、このウイルスに対して陽性のテストはありませんでした。キャリアはまだ不明です。バリア看護(または「ベッドサイド隔離」)の欠如は、病気のspread延を促進しました。 SUDVの平均致死率は、1976年に54%、1979年に68%、2000年と2001年に53%でした。Restonebolavirus(RESTV)このウイルスは、カニクイザルのサル出血熱ウイルス(SHFV)の発生中に発見されました。バージニア州レストンでの最初の発生以来、それはテキサス州ペンシルバニア州およびイタリアのシエナで非ヒト霊長類で発見されました。いずれの場合も、感染した動物はフィリピンの施設から輸入されており、ウイルスも豚に感染しています。レベル4の生物としての地位とサルでの明らかな病原性にもかかわらず、RESTVは暴露した人間の実験室労働者に病気を引き起こしませんでした。TaïForest ebolavirus(TAFV)以前は「コートジボワールebolavirus」として知られ、チンパンジーの間で最初に発見されました1994年、アフリカのコートジボワールのタイの森から。死体解剖では、心臓内の血が茶色であることを示した。臓器に明らかなマークは見られませんでした。ある剖検では、血液で満たされた肺が表示されました。チンパンジーから採取した組織の研究では、1976年にザイールとスーダンでエボラが発生した際のヒトの症例と同様の結果が示されました。より多くの死んだチンパンジーが発見されたので、多くは分子技術を使用してエボラ陽性をテストしました。ウイルスの発生源は、チンパンジーが獲物にした感染したウエスタンレッドコロブスサル( Procolobus badius )の肉であると考えられていました。感染したチンパンジーの剖検を行った科学者の一人がエボラに感染しました。彼女は剖検の約1週間後にデング熱の症状に似た症状を発症し、治療のためにスイスに移送されました。彼女は2週間後に退院し、感染から6週間後に完全に回復しました。ブンディブギョエボラウイルス(BDBV)2007年11月24日、ウガンダ保健省はブンディブギョ地区でエボラの発生を確認しました。米国国立基準研究所とCDCによってテストされたサンプルの確認後、世界保健機関は新種の存在を確認しました。 2008年2月20日、ウガンダ省は、ブンディブギョでの流行の終了を正式に発表し、最後の感染者は2008年1月8日に退院しました。WHOとウガンダ保健省の科学者が行った疫学研究では、新しいエボラ種、および発生の死亡率は34%(39人の死亡)でした。

進化

遺伝的変化の割合は、1年に1サイトあたり8 * 10-4であるため、ヒトのインフルエンザAの1/4の速さです。後方に外挿すると、エボラウイルスとマールブルクウイルスはおそらく数千年前に分岐しました。 1995年と1996年に行われた研究では、エボラウイルスとマールブルクウイルスの遺伝子は、ヌクレオチドレベルで約55%、アミノ酸レベルで少なくとも67%異なることがわかりました。同じ研究では、エボラウイルスの株がヌクレオチドレベルで約37〜41%、アミノ酸レベルで34〜43%異なることがわかりました。 EBOV株は、ヤムブキの発生からの最初の1976株と1995年のキクウィットの発生からの株から、ヌクレオチドレベルにほぼ2%の変化があることがわかりました。しかし、哺乳類に見られるフィロウイルスの古ウイルスは、家族自体が少なくとも数千万年前であることを示しています。

属の組織と一般名

エボラウイルス属は5つの種に分類されています。しかし、命名法は幾分議論の余地があることが判明しており、多くの著者はこれらのウイルスに言及する際に種名ではなく一般名を使用し続けています。特に、総称用語「エボラウイルス」は、 ザイールエボラウイルス種のメンバーを明確に指すために広く使用されています。その結果、2010年、研究者グループは、「エボラウイルス」という名前をザイールエボラウイルス種の下位分類に採用し、同様の共通名を他のエボラウイルス種に正式に採用することを推奨しました。 2011年、国際ウイルス分類委員会(ICTV)は、サブタイプ、バリアント、株、または他の亜種レベルのグループの名前を指定していないため、これらの名前を正式に認識する提案(2010.010bV)を拒否しました。そのため、広く使用されている一般名は、分類法の一部として正式に認識されていません。特に、「エボラウイルス」にはICTVによって認識される公式の意味はなく、むしろ、 ザイールエボラウイルス種のみを使用および推奨し続けています。

分離株を異なる種に入れるための閾値は、通常、タイプ株と比較してヌクレオチドレベルで30%以上の差です。ウイルスが特定の種に存在しているが、ヌクレオチドレベルでタイプ株と10%以上異なる場合、新しいウイルスとして命名することが提案されています。 2019年現在、 エボラウイルスの種には、複数の「ウイルス」指定を受け取るのに十分なほど多様なメンバーが含まれていません。

エボラウイルス :生物種やウイルス種名(略) ウイルスの共通名(略)Bombali エボラウイルス Bombaliウイルス(BOMV) ブンディブギョのエボラウイルス (BEBOV)ブンディブギョウイルス(BDBV) レストンエボラウイルス (REBOV)レストンウイルス(RESTV) スーダンエボラウイルス (SEBOV)スーダンウイルス(SUDV) タイフォレストエボラウイルス (TEBOV、以前はCIEBOV)タイフォレストウイルス(TAFV) ザイールエボラウイルス (ZEBOV)エボラウイルス(EBOV)

研究

2013年の研究では、バングラデシュのオオコウモリからエボラザイールおよびレストンウイルスに対する抗体が分離されたため、アジアのフィロウイルスの潜在的なウイルス宿主および兆候が特定されました。

現在の発生からのエボラウイルスゲノムの最近のアライメントフリー分析は、ヒトゲノムのどこにも現れない3つの短いDNA配列の存在を明らかにし、特定の種の配列の同定が診断と診断の両方に役立つことを証明することを示唆しています治療薬。

ノート

  1. ^クーンら2010年の提案は、「エボラウイルス」に種ザイールエボラウイルス内の「ウイルス」の分類学的ランクを与えることを具体的に提案しました。彼らの提案では、「エボラウイルス」とは、ゲノムがタイプバリアントザイールエボラウイルス (Mayinga)から10%未満しか分岐していないザイールエボラウイルス種のメンバーのことです。一般に、 ザイールエボラウイルス種のメンバーは、マイギンガタイプのバリアントから最大30%遺伝的に分岐することが許可されています。その結果、この提案により、「エボラウイルス」は一般名の同義語ではなく、 ザイールエボラウイルス種のサブセットになります。 「エボラウイルス」を種の同義語としてではなく、種のサブセットとして扱うことの区別はめったに使用されません。
  2. ^分岐によって提案された種