染色体10
染色体10は、人間の23組の染色体の1つです。人々は通常、この染色体の2つのコピーを持っています。染色体10は、約1億3,300万塩基対(DNAの構築材料)にまたがり、細胞内の全DNAの4〜4.5%を占めています。
遺伝子
遺伝子数
以下は、ヒト染色体10の遺伝子数の推定値の一部です。研究者はゲノムアノテーションにさまざまなアプローチを使用しているため、各染色体上の遺伝子数の予測は異なります(技術的な詳細については、遺伝子予測を参照)。さまざまなプロジェクトの中で、コラボレーティブコンセンサスコーディングシーケンスプロジェクト(CCDS)は非常に保守的な戦略を採用しています。したがって、CCDSの遺伝子数予測は、ヒトのタンパク質をコードする遺伝子の総数の下限を表します。
推定 | タンパク質をコードする遺伝子 | 非コードRNA遺伝子 | 偽遺伝子 | ソース | 発売日 |
---|---|---|---|---|---|
CCDS | 706 | — | — | 2016-09-08 | |
HGNC | 708 | 244 | 614 | 2017-05-12 | |
アンサンブル | 728 | 881 | 568 | 2017-03-29 | |
UniProt | 750 | — | — | 2018-02-28 | |
NCBI | 754 | 842 | 654 | 2017-05-19 |
遺伝子リスト
以下は、ヒト染色体10上の遺伝子の部分的なリストです。完全なリストについては、右側の情報ボックスのリンクを参照してください。
- AFAP1L2:アクチンフィラメント関連タンパク質1のような2
- ALL1エンコードタンパク質白血病、急性リンパ球、感受性1
- ALOX5:アラキドン酸5-リポキシゲナーゼ(必須脂肪酸を炎症反応の重要な薬剤であるロイコトリエンに処理します;また、癌幹細胞、白血病を含むさまざまな癌を引き起こすと考えられる細胞のゆっくりした分裂の発達と維持を促進します)
- ARHGAP21:rho GTPase活性化タンパク質21
- ARID5B:タンパク質ATリッチインタラクティブドメイン含有タンパク質5Bのコード化
- AS3MT:エンコード酵素亜ヒ酸メチルトランスフェラーゼ
- AVPI1:タンパク質アルギニンバソプレシン誘発タンパク質1のエンコード
- C10orf118:タンパク質の特徴づけられていないタンパク質C10orf118のエンコード
- C10orf67:染色体10オープンリーディングフレーム67
- C10orf76:染色体10オープンリーディングフレーム76
- C10orf99:タンパク質10番染色体の読み取り枠99のエンコード
- CAMK1D:カルシウム/カルモジュリン依存性プロテインキナーゼID
- CCAR1:細胞分裂サイクルとアポトーシス制御因子1
- CCDC3:コイルドコイルドメイン含有タンパク質3
- CCNY:サイクリン-Y
- CDC123:細胞分裂周期タンパク質123ホモログ
- CDH23:カドヘリン様23
- CDNF:脳ドーパミン神経栄養因子
- COMMD3-BMI1:COMMD3-BMI1リードスルー
- CUTC:銅の恒常性タンパク質cutCホモログ
- CXCL12:ケモカイン(CXCモチーフ)リガンド12、SDF-1、 scyb12
- DDX50:DExD-boxヘリカーゼ50
- DEPP:プロゲステロンによって誘導される脱落膜タンパク質
- DHX32:DEAH-box helicase 32
- DNAJC12:DnaJ(Hsp40)ホモログ、サブファミリーc、メンバー12
- DNAJC9:DnaJ(Hsp40)ホモログ、サブファミリーc、メンバー9
- DPYSL4:ジヒドロピリミジナーゼ関連タンパク質4
- EBLN1:内因性ボルナウイルス様核タンパク質1をコードするタンパク質
- ECD:エクジソンレス細胞周期調節因子
- EGR2:初期成長応答2(Krox-20ホモログ、ショウジョウバエ)
- EIF5AP1:真核生物翻訳開始因子5A様1
- EPC1:ポリコーム相同体1のエンハンサー
- ERCC6:切除修復交差補完rod歯類修復欠損、補完グループ6
- FAM107B:配列類似性107を持つファミリー、メンバーB
- FAM13C:配列類似性13、メンバーCを持つファミリー
- FAM170B:配列類似性170のメンバーBを含むタンパク質ファミリーをエンコード
- FAM188A:配列類似性188を持つファミリー、メンバーA
- FAM213A:配列類似性213を持つファミリー、メンバーA
- FAM25BPエンコードタンパク質Protein FAM25
- FAS-AS1、長い非コードRNA
- FGFR2:線維芽細胞成長因子受容体2(細菌発現キナーゼ、ケラチノサイト成長因子受容体、頭蓋顔面異形成症1、クルーゾン症候群、ファイファー症候群、ジャクソンワイス症候群)
- FRA10AC1:壊れやすい部位、葉酸タイプ
- FRAT1:WNTシグナル伝達経路調節因子
- FRAT2:WNTシグナル伝達経路調節因子
- 2を含むタンパク質FERMおよびPDZドメインをコードするFRMPD2
- GATA3:GATA3転写因子のエンコード。 GATA3は、副甲状腺、聴覚の神経成分、および腎臓の胚発生に重要です。遺伝子のハプロ不全はまれな障害、副甲状腺機能低下症、難聴、および腎異形成症候群の根底にあります
- GHITM:成長ホルモン誘導性膜貫通タンパク質
- GPRIN2:神経突起伸長のGタンパク質調節インデューサー2
- GTPBP4:核小体GTP結合タンパク質4
- HELLS:リンパ特異的ヘリカーゼ
- HKDC1:1を含むヘキソキナーゼドメイン
- KIN:DNA / RNA結合タンパク質KIN17
- MTG1:ミトコンドリアGTPase 1
- NPM3:ヌクレオプラスミン-3
- NRBF2:核内受容体結合因子2
- NSMCE4A:非SMC要素4ホモログA
- OTUD1:タンパク質OTU脱ユビキチン化酵素1のコード化
- PCBD1:肝細胞核因子1アルファ(TCF1)の6-ピルボイル-テトラヒドロプテリンシンターゼ/二量化コファクター
- PCDH15:プロトカドヘリン15
- PI4K2A:ホスファチジルイノシトール4-キナーゼ2-アルファ
- PIP4K2A:ホスファチジルイノシトール5リン酸4-キナーゼタイプ2アルファ
- PITRM1:ピトリリシンメタロペプチダーゼ1
- S1を含むタンパク質プレクストリン相同ドメインをコードするPLEKHS1
- PLXDC2:プレキシンドメイン含有タンパク質2
- PROSER2:プロリンおよびセリンリッチ2またはc10orf47
- PTEN遺伝子:ホスファターゼとテンシンのホモログ(複数の進行癌で変異1)
- RET:ret癌原遺伝子(多発性内分泌腫瘍および甲状腺髄様癌1、ヒルシュスプルング病)
- RPP30:リボヌクレアーゼPタンパク質サブユニットp30
- RRP12:リボソームRNAプロセッシング12ホモログ
- RSU1:rasサプレッサータンパク質1
- SGPL1:スフィンゴシン-1-リン酸リアーゼ1
- SMNDC1:1を含む生存運動ニューロンドメイン
- SPG9エンコードタンパク質痙性対麻痺9(常染色体優性)
- SRGN:セルグリシン
- STAMBPL1:1のようなSTAM結合タンパク質
- STOX1:タンパク質Storkheadボックス1のエンコード
- SUPV3L1:RNAヘリカーゼのようなSuv3
- TACC2エンコードタンパク質酸性のコイルドコイル含有タンパク質2の変換
- TBC1D12:TBC1ドメインファミリー、メンバー12
- TCTN3:テクトニックファミリーメンバー3
- TMEM10:オパリン
- TMEM26:コード化タンパク質膜貫通タンパク質26
- UCN3:ウロコルチン-3
- UROS:ウロポルフィリノーゲンIIIシンターゼ(先天性赤血球産生ポルフィリン症)
- USP6NL:USP6 N末端様タンパク質
- UTF1:未分化胚細胞転写因子1
- WASHC2C:WASH複合サブユニット2C
- WBP1L:WWドメイン結合タンパク質1様
- ZNF37A:ジンクフィンガータンパク質37A
- ZNF438:ジンクフィンガータンパク質438
病気と障害
次の病気は染色体10の遺伝子に関連しています:
- アペール症候群
- Beare–Stevenson cutis gyrata症候群
- シャルコー・マリー・ツース病
- コケイン症候群
- 先天性赤血球産生性ポルフィリン症
- カウデン症候群
- クルーゾン症候群
- 多形膠芽腫
- ヘルマンスキー・パドラック症候群
- ヒルシュプルング病
- ジャクソン・ワイス症候群
- 多発性内分泌腫瘍2型
- 非症候性難聴
- ファイファー症候群
- ポルフィリン症
- テトラヒドロビオプテリン欠乏症
- ティエル・ベンケ角膜ジストロフィー
- アッシャー症候群
- ウォルマン症候群
細胞遺伝学的バンド
解像度850 bphsのヒト染色体10のGバンドChr。アームバンドISCNISCNを開始
Basepairを停止
Basepairを開始
stop Stain Density 10 p 15.3 0 229 1 3,000,000 gneg 10 p 15.2 229329 3,000,001 3,800,000 gpos 25 10 p 15.1 329 630 3,800,001 6,600,000 gneg 10 p 14630917 917 6,600,001 12,200,000 gpos 75 10 p 13 917 1175 12,200,001 17,300,000 gneg 10 p 12.33 1175 1361 17,300,001 18,300,000 gpos 75 10 p 12.32 1361 1432 18,300,001 18,400,000 gneg 10 p 12.31 1432 1604 18,400,001 22,300,000 gpos 75 10 p 12.2 1604 1662 22,300,001 24,300,000 gneg 10 p 12.1 1662 1891 24,300,001 29,300,000 gpos 50 10 p 11.23 1891 2063 29,6300,000 2235 31,100,001 34,200,000 gpos 25 10 p 11.21 2235 2406 34,200,001 38,000,000 gneg 10 p 11.1 2406 2621 38,000,001 39,800,000 acen 10 q 11.1 2621 2850 39,800,001 41,600,000 acen 10 q 11.21 2850 3051 41,600,001 45,500,000 gneg 10 q 11.22 3051 256 45,500,000 gneg 10 q 11.500 3409 48,600,001 51,100,000 gneg 10 q 21.1 3409 3753 51,100,001 59,400,000 gpos 100 10 q 21.2 3753 3839 59,400,001 62,800,000 gneg 10 q 21.3 3839 4097 62,800,001 68,800 、000 gpos 100 10 q 22.1 4097 4469 68,800,001 73,100,000 gneg 10 q 22.2 4469 4655 73,100,001 75,900,000 gpos 50 10 q 22.3 4655 4970 75,900,001 80,300,000 gneg 10 q 23.1 4970 5200 80,300,001 86,100,000 gpos 100 10 q 23.2 5200 5331 867001 5558 87,700,001 91,100,000 gpos 75 10 q 23.32 5558 5672 91,100,001 92,300,000 gneg 10 q 23.33 5672 5887 92,300,001 95,300,000 gpos 50 10 q 24.1 5887 5973 95,300,001 97,500,000 gneg 10 q 24.2 5973 6gn 10100 24100 10100 1001 100.100.100.100.100.100.100.100.100.100.100.100.100.100.100.100.100.100.100.100.100.100.24 6202 6317 101,200,001 103,100,000 gpos 25 10 q 24.33 6317 6374 103,100,001 104,000,000 gneg 10 q 25.1 6374 6646 104,000,001 110,100,000 gpos 100 10 q 25.2 6646 6761 110,100,001 113,100,000 gneg 10 q 25.3 6761 6890 113,1090,117 1090,119.100,001 1090,119.000,1090,119.000 1090,119.000 26.12 7090 7219 119,900,001 121,400,000 gpos 50 10 q 26.13 7219 7506 121,400,001 125,700,000 gneg 10 q 26.2 7506 7721 125,700,001 128、 800,000 gpos 50 10 q 26.3 7721 8050 128,800,001 133,797,422 gneg