カリモウイルス科

カリモウイルス科は植物に感染するウイルスの一種です。二本鎖DNA（dsDNA）と呼ばれる家族Caulimoviridaeに属する8 genera.Viruses間で分割この家族の中で68種、逆転写ウイルス（またはpararetroviruses）すなわちそれらの複製サイクルでの逆転写段階が含まれているウイルスは現在ありません。このファミリーには、ライフサイクルに逆転写段階があるdsDNAゲノムを持つすべての植物ウイルスが含まれています。

分類学

グループ：dsDNA-RT

ウイルス粒子構造

このファミリーのすべてのウイルスはエンベロープがありません。ウイルス粒子は、菌または等尺性です。ウイルス構造に組み込まれたヌクレオカプシドのタイプにより、ウイルス粒子のサイズが決まります。 ac菌状粒子の直径は約35〜50 nmで、長さは最大900 nmです。等尺性粒子の直径は平均で45〜50 nmで、20面体対称を示します。

ゲノム構造と複製

このファミリーのウイルスのゲノムには、特定の場所の両方のゲノム鎖に不連続性がある7.2〜9.3 kbpの非共有結合で閉じた一本鎖の環状dsDNAが含まれています。これらのゲノムには、ペトウイルスで見られる1つのオープンリーディングフレーム（ORF）から、ソイモウイルスなどの8つのORFまでが含まれています。ウイルスゲノムによってコードされるタンパク質には、逆転写酵素、リボヌクレアーゼH、プロテアーゼ、ヌクレオカプシド、およびトランス活性化因子が含まれます。特定の機能がまだ割り当てられていない複製に不可欠な他のタンパク質があります。

複製は、細胞質と宿主細胞の核の両方で起こります。まず、ウイルスゲノムが細胞質に入ります。ウイルスDNAは、宿主核に入るとスーパーコイルミニ染色体構造を形成し、そこで最終的に冗長なポリアデニル化RNAに転写されます（DNAの一部で転写が2回発生するため）。新しく転写されたRNAは細胞質に入り、そこでウイルスタンパク質に翻訳されるか、ウイルス逆転写酵素によってdsDNAウイルスゲノムの新しいコピーに逆転写されます。新しいdsDNAゲノムは細胞質に包まれて放出されます。

複製プロセスにはレトロな転写ステップとRNA中間体が含まれるため、 Caulimoviridae科のウイルスは真のdsDNAウイルスとは見なされず、代わりにDNA逆転写ウイルスと呼ばれます。彼らはこの特性をレトロウイルスと共有しています。ただし、レトロウイルスとは異なり、 Caulimoviridae科のウイルスは、複製するためにウイルスゲノムを宿主のゲノムに組み込む必要がなく、このため、ゲノムは酵素タンパク質インテグラーゼをコードしません。

植物ゲノム内の内因性ウイルス要素（EVE）の存在は広まっています。そして、ほとんどの既知の植物EVEは、 Caulimoviridae科の DNAゲノムを持つウイルスに由来します。統合は、DNA修復メカニズム中の非相同末端結合（非正統的組換え）により発生すると考えられています。ほとんどの植物EVEは非感染性です。しかし、ペチュニア（ ペチュニア静脈除去ウイルス）、バナナ（ バナナストリークOLウイルス 、 バナナストリークGFウイルス 、 バナナストリークIMウイルス）およびニコチアナエドワードソニイ （ タバコ静脈除去ウイルス ）のゲノムでは、感染性カリモウイルス科 EVEが報告されています。