バイオパニング

バイオパニングは、特定のターゲットに結合するペプチドを選択するアフィニティ選択技術です。コンビナトリアルペプチドライブラリーを使用したバイオパニングから得られたすべてのペプチド配列は、BDBという名前の特別に無料で利用可能なデータベースに保存されています。この手法は、抗体の選択にもよく使用されます。

バイオパニングには、ペプチド選択のための4つの主要なステップが含まれます。最初のステップは、ファージディスプレイライブラリを準備することです。これには、バクテリオファージゲノムの領域に目的の外来遺伝子セグメントを挿入し、バクテリオファージビリオンの表面にペプチド産物が表示されるようにします。最も頻繁に使用されるのは、バクテリオファージM13の遺伝子pIIIまたはpVIIIです。次の手順はキャプチャ手順です。それは、ファージライブラリを所望の標的に結合することを含む。この手順はパンニングと呼ばれます。バクテリオファージが提示する特定のペプチドのみがターゲットに結合するように、結合相互作用を利用します。例えば、バクテリオファージによって提示された抗体をマイクロタイタープレートにコーティングされた抗原とともに選択します。

洗浄ステップは、捕捉ステップの後に行われ、結合していないファージを固体表面から洗い流します。強い親和性を持つ結合ファージのみが保持されます。最後のステップには、pHの変更またはその他の環境条件によって結合したファージが溶出される溶出ステップが含まれます。

最終結果は、バクテリオファージによって産生されるペプチドが特異的であるということです。得られた繊維状ファージは、グラム陰性細菌に再び感染して、ファージライブラリーを生成します。このサイクルは何度も発生する可能性があり、その結果、ペプチドが標的に強く結合します。